More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0859 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  773    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  58.78 
 
 		 376 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  54.26 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  55.05 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  53.74 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  52.82 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  39.3 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  39.25 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  40.21 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  37.63 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  41.49 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  36.22 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  37.43 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  35.01 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  35.38 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  36.86 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  35.05 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  27.89 
 
 		 369 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  27.89 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.02 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.13 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.91 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.69 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.47 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.61 
 
 		 377 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.1 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.69 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.41 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.82 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  28.24 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  26.73 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.06 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.33 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  25.59 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.68 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.21 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.2 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25.78 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  27.25 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  27.82 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  27.09 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  26.16 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.95 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.93 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  27.09 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.4 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.52 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  25.14 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.22 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  27.41 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  27.41 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  26.19 
 
 		 467 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  25.87 
 
 		 374 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  25.14 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  25 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  27.11 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  26.35 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.89 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.01 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.69 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  39.82 
 
 		 123 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  24.55 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.8 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.28 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.77 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  27.03 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  25.86 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  26.32 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  25.15 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25.14 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  24.61 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.27 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  28.03 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.33 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  26.91 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  29.15 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  25.95 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>