More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3284 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
393 aa  789    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  48.74 
 
 
408 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  48.61 
 
 
399 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  45.32 
 
 
392 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  46.84 
 
 
392 aa  322  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  48.35 
 
 
423 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  43.4 
 
 
408 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  46.25 
 
 
402 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  43.83 
 
 
408 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  43.15 
 
 
408 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  42.68 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  41.69 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  39.26 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8535  monooxygenase FAD-binding  38.62 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.0015439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4263  monooxygenase FAD-binding  36.78 
 
 
398 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000952252  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  29.68 
 
 
421 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  31.71 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  31.25 
 
 
376 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 
376 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 
376 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  27.17 
 
 
377 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  32.68 
 
 
390 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
419 aa  123  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  31.97 
 
 
374 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  29.48 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  30.75 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  30.1 
 
 
384 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.79 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  27.46 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.37 
 
 
377 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.15 
 
 
397 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  31.59 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  28.42 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  32.85 
 
 
369 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
367 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  32.17 
 
 
382 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.32 
 
 
407 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  27.98 
 
 
376 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.86 
 
 
395 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.73 
 
 
379 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  29.97 
 
 
368 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 
368 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
388 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.57 
 
 
377 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  32.14 
 
 
369 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.49 
 
 
406 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.25 
 
 
397 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  26.52 
 
 
469 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 
402 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.75 
 
 
388 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 
382 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.09 
 
 
384 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  31.8 
 
 
374 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  32.44 
 
 
382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  30.68 
 
 
384 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
400 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  32.44 
 
 
382 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 
396 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.21 
 
 
386 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  31.66 
 
 
388 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.99 
 
 
404 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.44 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.68 
 
 
404 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.46 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
387 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.42 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.51 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  27.93 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1528  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
362 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.392805  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  30.08 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.49 
 
 
415 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
384 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.68 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  30.32 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  32.43 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  32.43 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  28.3 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.13 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.92 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 
395 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.69 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.19 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  28.75 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.97 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>