More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1684 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 373 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  44.44 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  39.25 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  40.91 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  42.66 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  40.69 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  38.46 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  38.24 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  38.96 
 
 		 371 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  40.59 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  35.5 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  36.9 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  37.4 
 
 		 376 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  35.67 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  37.32 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  33.62 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  35.8 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.36 
 
 		 377 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  25.86 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.2 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  25.55 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.51 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  49.57 
 
 		 123 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  27.48 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  32.13 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.77 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.77 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.14 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.19 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.72 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.96 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.27 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.13 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.09 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.39 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.23 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  22.78 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  30.32 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.85 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  28.82 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.57 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.41 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.41 
 
 		 374 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.29 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.5 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  31.52 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  25.55 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.57 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.58 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  30.03 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  30.03 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.84 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  26.81 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  27.64 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02033  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.637061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  29.84 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  25.48 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  26.65 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  25.18 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.86 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  29.81 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  28.13 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  30.51 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 		 384 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  26.35 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  32.79 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  27.11 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  26.5 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.23 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  28.98 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  30.98 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  29.97 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  27.53 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.89 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>