More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0385 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  71.1 
 
 		 389 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  45.13 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  44.81 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  40.2 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  40.94 
 
 		 400 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.43 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  35.61 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  39.06 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  39.68 
 
 		 399 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  37.34 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  35.59 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  36.62 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  35.88 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  38.48 
 
 		 374 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.86 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  35.28 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  34.21 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  37.95 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  36.32 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  36.6 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.24 
 
 		 403 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  34.84 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  35.43 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 		 415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  35.17 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  35.17 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.65 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  37.06 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  34.57 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  31.39 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.13 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 413 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  31.96 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  31.19 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.69 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  32.76 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.22 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.21 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.3 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  32.24 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  32.45 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.19 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  32.68 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.77 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.62 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.3 
 
 		 496 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.49 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  29.71 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  30.68 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.13 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.75 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.58 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  23.58 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.12 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.67 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.45 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.32 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.98 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.59 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  25.5 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.64 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  24.92 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  27.84 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  28.13 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  26.98 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.01 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.21 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.71 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  27.79 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.61 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.12 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.68 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  27.53 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  25.36 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>