More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1265 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
396 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  36.8 
 
 
388 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  36.94 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  35.49 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  36.03 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  36.15 
 
 
496 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.02 
 
 
390 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  36.62 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  37.28 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  40.44 
 
 
393 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  38.11 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  32.4 
 
 
388 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.09 
 
 
389 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.93 
 
 
405 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.69 
 
 
400 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 
377 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.77 
 
 
387 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  31.65 
 
 
391 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  35 
 
 
400 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  31.97 
 
 
407 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.22 
 
 
386 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.28 
 
 
398 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  34.04 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  33.78 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  33.74 
 
 
399 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.7 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  32.48 
 
 
404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  35.17 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 
415 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  32.65 
 
 
408 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  33.92 
 
 
372 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  29.61 
 
 
402 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  32.66 
 
 
374 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 
372 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  32.01 
 
 
371 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  30.24 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  30.71 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  30.95 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 
388 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  29.52 
 
 
424 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  32.29 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  31.83 
 
 
400 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
371 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  32.58 
 
 
400 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  32.58 
 
 
400 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  32.37 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 
370 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  28.29 
 
 
415 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  34.44 
 
 
387 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.22 
 
 
384 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.59 
 
 
403 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
393 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  29.82 
 
 
403 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.14 
 
 
351 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  32.63 
 
 
411 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  31.08 
 
 
377 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  29.5 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
374 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  29.74 
 
 
402 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.48 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  30.31 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  32.27 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.42 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  31.86 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  25.79 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.04 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.15 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.12 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.87 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.9 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.96 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  29.71 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.76 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.16 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.84 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.57 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.18 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.3 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.36 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  22.79 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.64 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.4 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.16 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.15 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.32 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.54 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>