More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5341 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
418 aa  834    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  65.54 
 
 
413 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  45.74 
 
 
496 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  49.71 
 
 
381 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  37.37 
 
 
405 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  40.57 
 
 
392 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  35.66 
 
 
396 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  35.66 
 
 
388 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  32.82 
 
 
394 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  34.73 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.98 
 
 
390 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  36.94 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  33.15 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  33.81 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.45 
 
 
389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  32.01 
 
 
371 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  32.05 
 
 
386 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  37.79 
 
 
393 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  36.07 
 
 
377 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
402 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  30.91 
 
 
399 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.72 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 
372 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  33.51 
 
 
400 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  29.95 
 
 
407 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  33.51 
 
 
400 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  33.51 
 
 
400 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
388 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 
424 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  31.52 
 
 
400 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  33.52 
 
 
374 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  32.28 
 
 
400 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.07 
 
 
403 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 
380 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  32.89 
 
 
387 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  30.59 
 
 
372 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  31.19 
 
 
391 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  29.73 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.15 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  28.5 
 
 
424 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  32.3 
 
 
395 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
371 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  33.05 
 
 
415 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 
370 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  33.99 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  30.63 
 
 
393 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  31.14 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  29.84 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 
398 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  32.59 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.86 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 
384 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.27 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  29.85 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 
373 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  29.56 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30.08 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  28.57 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.08 
 
 
382 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 
421 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
376 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  25.79 
 
 
391 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.96 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.94 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 
369 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 
382 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 
385 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.89 
 
 
377 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.69 
 
 
377 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.61 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.61 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.24 
 
 
371 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  25.37 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.14 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  27.53 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.85 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.9 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  28.77 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  27.95 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  26.29 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  25.97 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.6 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  26.45 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.02 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  27.27 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  28.34 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.13 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  25.41 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.05 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>