292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1730 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
395 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  45.57 
 
 
396 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  44.47 
 
 
388 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  43.56 
 
 
388 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  48.35 
 
 
393 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.43 
 
 
387 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  36.62 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  34.69 
 
 
394 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.58 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.68 
 
 
388 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
413 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
386 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  36.04 
 
 
434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.15 
 
 
400 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  35.66 
 
 
496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.56 
 
 
418 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  34.18 
 
 
381 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 
402 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.85 
 
 
404 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  33.42 
 
 
391 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  33.42 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  33.98 
 
 
372 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  31.23 
 
 
407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 
372 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  30.71 
 
 
399 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 
402 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  30.27 
 
 
400 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  30.27 
 
 
400 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  31.55 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.02 
 
 
398 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  30.28 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.94 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.95 
 
 
384 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  29.21 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 
396 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 
388 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 
380 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  27.84 
 
 
424 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  31.92 
 
 
411 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  28.79 
 
 
397 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  26.84 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  27.04 
 
 
467 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 
424 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  26.01 
 
 
423 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  29.32 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  26.53 
 
 
415 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  29.82 
 
 
378 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.44 
 
 
379 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.5 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  25.33 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.34 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  28.05 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.85 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.15 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  23.19 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  25.87 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  27.34 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  32.84 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  27.34 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  27.34 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  27.34 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  27.34 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  27.2 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  27.18 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  27.08 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.04 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  25.78 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.78 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.3 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.17 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.17 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  24.74 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  25.53 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.18 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.76 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.52 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.83 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.04 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  24.21 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  24.79 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.77 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.83 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>