More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  100 
 
 
399 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  65.16 
 
 
402 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  56.39 
 
 
407 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  46.48 
 
 
404 aa  345  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  52.05 
 
 
374 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  50.14 
 
 
371 aa  338  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  53.8 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  49.01 
 
 
393 aa  322  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  48.28 
 
 
372 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  45.73 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  42.29 
 
 
424 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  42.61 
 
 
402 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  44.53 
 
 
424 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  48.53 
 
 
400 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42.6 
 
 
398 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  42.46 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  42.66 
 
 
397 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  41.16 
 
 
415 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  42.17 
 
 
400 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  42.17 
 
 
400 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  42.09 
 
 
400 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  43.44 
 
 
396 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40 
 
 
403 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  43.12 
 
 
377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  41.01 
 
 
388 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  41.74 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  38.44 
 
 
370 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  39.05 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  41.16 
 
 
389 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.52 
 
 
411 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  40.18 
 
 
380 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  38.96 
 
 
398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 
390 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
371 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  35.26 
 
 
372 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  39.68 
 
 
391 aa  222  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  39.94 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  41.01 
 
 
400 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  36.13 
 
 
384 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  38.44 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  35.16 
 
 
467 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  36.22 
 
 
408 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 
388 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.5 
 
 
396 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.78 
 
 
423 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  34.8 
 
 
496 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  30.91 
 
 
418 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 
388 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.73 
 
 
388 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  33.33 
 
 
351 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  36.87 
 
 
381 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
413 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  31.87 
 
 
434 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
386 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.29 
 
 
393 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.74 
 
 
396 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 
392 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.05 
 
 
405 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.64 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.49 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.19 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 
373 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 
411 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.18 
 
 
387 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.09 
 
 
376 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 
404 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.61 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  28.01 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.61 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.76 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  27.73 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.16 
 
 
374 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.94 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.51 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  29.11 
 
 
399 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.08 
 
 
376 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.45 
 
 
369 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.17 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  26.61 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.79 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.05 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.78 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.61 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.82 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  19.62 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.73 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  26.79 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.49 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  25.66 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.52 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  27.79 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  25.86 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  25.94 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.81 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>