296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0093 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  92.31 
 
 		 351 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  100 
 
 		 467 aa  954    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  56.38 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  55.03 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  45.69 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  45.04 
 
 		 397 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  44.13 
 
 		 400 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.36 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  44.1 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  45.14 
 
 		 393 aa  257  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  40.28 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  37.25 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  38.73 
 
 		 407 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  37.34 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  37 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  37 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.38 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  34.84 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  35.57 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  35.16 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  37.35 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  37.12 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  36.48 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  36.07 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.78 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  34.92 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  36.25 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  34.97 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.93 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  39.81 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  38.18 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.79 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.44 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  35.79 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  30.91 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  31.63 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  29.57 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  31.96 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  31.28 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.09 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.99 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.14 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  31.95 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.37 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.29 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  27.62 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  28.53 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.56 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  29.22 
 
 		 376 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  28.34 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.1 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  27.04 
 
 		 395 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  26.28 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 		 373 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.97 
 
 		 368 aa  86.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.69 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.13 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  23.75 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.88 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.78 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  26.81 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.91 
 
 		 369 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  31.37 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.62 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.36 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.95 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.63 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  25.4 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.7 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.43 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.38 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  27.67 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.29 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  32.26 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.48 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  26.93 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.76 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.76 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  27.38 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.36 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  30.71 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.72 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  25.9 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.22 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>