More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0514 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  97.39 
 
 		 421 aa  813    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  854    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  48.43 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  52.82 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  48.07 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  45.05 
 
 		 421 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  47.47 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  47.43 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  43.53 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  44.11 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  44.72 
 
 		 413 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  46.72 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  46.56 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  44.74 
 
 		 414 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  41.79 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  41.54 
 
 		 432 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  44.33 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  45.59 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  40.98 
 
 		 441 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  42.64 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  42.64 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  42.64 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  42.64 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  42.64 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  42.39 
 
 		 414 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  42.39 
 
 		 414 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  42.04 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  44.39 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  44.12 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  41.63 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  40.66 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  39.41 
 
 		 430 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  40.41 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  42.66 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.96 
 
 		 400 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  34.06 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.91 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  31.78 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  35.26 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  32.79 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  34.03 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.17 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.71 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.71 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.44 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.67 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  33.17 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.22 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  31.65 
 
 		 402 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.17 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.38 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.65 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.43 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.06 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  32.62 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.95 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.61 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  29.7 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.9 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  29.65 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  29.65 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  30.65 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.5 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.74 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  27.84 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  29.27 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.07 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.79 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  29.92 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  32.02 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  29.76 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  28.53 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  32.72 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  26.68 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.34 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.76 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.09 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>