More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3990 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 415 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.68 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  41.16 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  41.82 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  41.33 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  38.73 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.64 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  38.01 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  36.47 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  38.11 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.67 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  36.78 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  36.77 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  34.82 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  38.34 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  35.32 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  35.32 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  35.43 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  35.96 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  38.73 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  35.08 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  36.64 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.9 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.91 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.76 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  34.05 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.06 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  30.71 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  32.48 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.38 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  29.47 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  31.81 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  32.42 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  29.73 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  32.87 
 
 		 400 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.97 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.83 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  27.78 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.84 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.36 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.35 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  25.58 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  26.16 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  26.54 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  27.64 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  26.38 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.5 
 
 		 395 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  27.75 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  27.52 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  25.99 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.6 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  24.22 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.96 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  29.36 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.03 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.46 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.51 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.82 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.18 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  24.46 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.97 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  25.45 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  25 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.03 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  23.44 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.2 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.07 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.18 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  25.26 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  26.99 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  25.53 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  26.7 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.38 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  26.42 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  25.72 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  24.44 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  25.47 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  26.42 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  26.42 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  26.42 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>