More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2849 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1770  hypothetical protein  99.27 
 
 
440 aa  835    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2974  hypothetical protein  99.03 
 
 
414 aa  835    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556187  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2849  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0391  hypothetical protein  99.27 
 
 
440 aa  835    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0439  hypothetical protein  99.27 
 
 
440 aa  835    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1214  hypothetical protein  99.76 
 
 
414 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1585  hypothetical protein  99.27 
 
 
440 aa  835    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.825888  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  47.83 
 
 
420 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2927  hypothetical protein  44.27 
 
 
424 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.27992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3698  hypothetical protein  43.46 
 
 
417 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0252348  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  43.52 
 
 
413 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  42.64 
 
 
421 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3061  hypothetical protein  41.67 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0232846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0336  monooxygenase FAD-binding protein  41.62 
 
 
412 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214027  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  41.79 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4355  hypothetical protein  41.5 
 
 
421 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0233973  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  43.16 
 
 
417 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  42.09 
 
 
417 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  43.39 
 
 
414 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  42.31 
 
 
402 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  42.31 
 
 
402 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5023  monooxygenase FAD-binding protein  43.44 
 
 
413 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0794  hypothetical protein  40.74 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.711423  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4386  hypothetical protein  38.69 
 
 
441 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3637  hypothetical protein  41.77 
 
 
416 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529402  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2684  hypothetical protein  40.62 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552249  normal  0.307817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2238  hypothetical protein  38.7 
 
 
430 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1945  hypothetical protein  37.6 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165193  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1206  hypothetical protein  40.51 
 
 
417 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4108  hypothetical protein  38.62 
 
 
430 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.645862  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3441  hypothetical protein  37.67 
 
 
417 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819399  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0298  monooxygenase FAD-binding protein  40.16 
 
 
433 aa  226  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7587  hypothetical protein  38.28 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.383946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  37.67 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  32.07 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
399 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.61 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  33.77 
 
 
412 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  33.06 
 
 
385 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  31.35 
 
 
400 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.83 
 
 
397 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  31.97 
 
 
412 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  32.46 
 
 
400 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  32.49 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.98 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  31.54 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.93 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.65 
 
 
403 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.11 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
364 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
364 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.48 
 
 
377 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.93 
 
 
360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  31.96 
 
 
399 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
413 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.74 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  29.91 
 
 
400 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.72 
 
 
404 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.27 
 
 
376 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 
376 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  31.87 
 
 
386 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.18 
 
 
376 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.81 
 
 
378 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.03 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 
396 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
404 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
387 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.72 
 
 
404 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  28.49 
 
 
401 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  27.6 
 
 
386 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  30.81 
 
 
373 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  29.01 
 
 
397 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  29.33 
 
 
406 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.24 
 
 
399 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  28.73 
 
 
397 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  28.73 
 
 
397 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  28.73 
 
 
397 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.43 
 
 
374 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.35 
 
 
395 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  28.73 
 
 
397 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  31.94 
 
 
430 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  29.02 
 
 
400 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
390 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.46 
 
 
373 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  30.38 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  27.71 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0310  monooxygenase FAD-binding protein  27.39 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0496808  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  27.71 
 
 
402 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  27.92 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  29.21 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  31.45 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  32.32 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  27.72 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  27.75 
 
 
402 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>