297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5428 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  48.72 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  47.95 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  45.13 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  36.29 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  39 
 
 		 407 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  34.34 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  37.8 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  37.18 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  34.65 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  38.44 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.6 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.09 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.82 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.53 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  34.5 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.33 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.85 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  36.9 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.34 
 
 		 404 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  33.61 
 
 		 496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  35.65 
 
 		 387 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  30.77 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  36.18 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  32.45 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  31.52 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  29.29 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  32.86 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  32.58 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  32.58 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  35.04 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  29.57 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  31.34 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 		 434 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  27.18 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.81 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  28.01 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  26.7 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  25.89 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.45 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.57 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.38 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.61 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  25.89 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  26.23 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  26.49 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  25.31 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  26.49 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  20.36 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  25.43 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  27.3 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  26.36 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  26.59 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.1 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  26.77 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  24.81 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  21.11 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  26.77 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  26.77 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  21.11 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  26.65 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.71 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  24.45 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  27.66 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  23.95 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  26.57 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  26.83 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  23.48 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.3 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  25.23 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  25.3 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  24.68 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  26.06 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  23.08 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>