More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2318 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
385 aa  791    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  69.61 
 
 
384 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  64.8 
 
 
392 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  55.47 
 
 
388 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  54.4 
 
 
395 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  50.26 
 
 
397 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  48.88 
 
 
410 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  34.23 
 
 
390 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  31.69 
 
 
377 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.03 
 
 
378 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  30.49 
 
 
377 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  29.66 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  31.7 
 
 
409 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.46 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  29.05 
 
 
377 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  35.52 
 
 
382 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
420 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  35.05 
 
 
389 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  35.05 
 
 
389 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 
388 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  34.37 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  30.92 
 
 
374 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  34.73 
 
 
389 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
367 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  32.47 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  32.05 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  33.23 
 
 
378 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 
392 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  31.74 
 
 
388 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 
376 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
393 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
404 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.91 
 
 
393 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.18 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  33.62 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  27.32 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  31.71 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.85 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.13 
 
 
422 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.02 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.48 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  29.45 
 
 
374 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  29.13 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  30 
 
 
429 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  33.12 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  28.78 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  28.78 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
425 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  29.97 
 
 
388 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1561  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 
392 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0688558  normal  0.0725424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.95 
 
 
364 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  28.9 
 
 
404 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.95 
 
 
364 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.17 
 
 
408 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
378 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.75 
 
 
360 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19150  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.39 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0319604  normal  0.370849 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  26.56 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.72 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
410 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.83 
 
 
408 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  31.53 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.33 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  28.7 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  28.7 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  28.79 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  28.79 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 
382 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.71 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
383 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_56492  zeaxanthin epoxidase  28.29 
 
 
557 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688102  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.87 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.18 
 
 
386 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.27 
 
 
385 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.52 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  27.81 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  28.48 
 
 
385 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.34 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 
378 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.65 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.22 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  28.84 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  29.91 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30.38 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  28.21 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  26.88 
 
 
385 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
395 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  30.03 
 
 
400 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.19 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  24.86 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 
382 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.91 
 
 
421 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  31.07 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>