More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5490 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  57.71 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  57.45 
 
 		 376 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  55.05 
 
 		 376 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  49.6 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  46.95 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  44.9 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  43.32 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  39.78 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  40.69 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  40.11 
 
 		 376 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  36.29 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  38.61 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  40.98 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  39.27 
 
 		 372 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  37.43 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  35.82 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  36.1 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  26.98 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  26.98 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  32.48 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.73 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  31.22 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.86 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.37 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.64 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.92 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  32.46 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.69 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  26.1 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  26.61 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.66 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.95 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  27.16 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  30.17 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.62 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  29.38 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  29.8 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  28.2 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  27.81 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  31.49 
 
 		 421 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.12 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.12 
 
 		 404 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.18 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  31.07 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  26.87 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.39 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.85 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  30.57 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  30.57 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  31.44 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  29.15 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  30.72 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  30.72 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  27.98 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  29.17 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  30.79 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.52 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.08 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.14 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  30.62 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.08 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.34 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.24 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.77 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.61 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.61 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  26.34 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  47.22 
 
 		 123 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>