239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4339 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 434 aa  863    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  56.76 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  57.02 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  37.11 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  36.76 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  38.67 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.24 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  31.87 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  34.91 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  35.03 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  30.26 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  33.97 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.16 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  33.6 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  31.27 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  34.88 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  32.5 
 
 		 388 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  32.19 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.25 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.7 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.35 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  33.89 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  34.27 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  33.89 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  33.89 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  32.64 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.43 
 
 		 415 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  31.96 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  34.82 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  32.86 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  29.2 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  32.5 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  30.77 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  33.91 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.87 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  26.33 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  29.95 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  31.38 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  28.27 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  27.05 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  30.85 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  25.13 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  28.34 
 
 		 467 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.83 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.42 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.44 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.92 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.7 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  27.92 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.7 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.92 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 374 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  27.75 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  25.69 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.11 
 
 		 377 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  33.7 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  31.98 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.56 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.78 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  21.68 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.2 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  26.74 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 537 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 559 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.5 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.14 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  26.37 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  25.56 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  25.87 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.91 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.66 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  25.28 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2599  Kynurenine 3-monooxygenase  25.8 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0833412  normal  0.344661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  26.21 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  25.28 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>