More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1150 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
397 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  53.54 
 
 
385 aa  339  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  42.75 
 
 
411 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  40.75 
 
 
402 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  41.62 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  43.41 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  37.73 
 
 
442 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  36.45 
 
 
442 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  40.38 
 
 
407 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  36.86 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  41.08 
 
 
399 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.33 
 
 
441 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  30.33 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.87 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.35 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.28 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  28.96 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.75 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.13 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  24.31 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  24.31 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.29 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  27.12 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.12 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.94 
 
 
439 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.94 
 
 
439 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  24.54 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.34 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  23.38 
 
 
455 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  22.22 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.34 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.44 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.15 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.69 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
417 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.29 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
475 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
425 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 
457 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  25.33 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  33.52 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  34.39 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  26.21 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  22.39 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  28.01 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  37.06 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  34.13 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  32.04 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  27.33 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47310  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.93 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  30.92 
 
 
508 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
411 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01668  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  32.12 
 
 
429 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01657  hypothetical protein  32.12 
 
 
429 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  36.14 
 
 
423 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2416  hypothetical protein  31.61 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  24.32 
 
 
428 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  36.14 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  22.4 
 
 
416 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 
430 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  24.04 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.73 
 
 
470 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1943  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.25 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  27.19 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  23.62 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  24.04 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  21.85 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  26.09 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0369  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 
418 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1932  hypothetical protein  31.61 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1902  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  40 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  26.32 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  26.1 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>