More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0442 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  841    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  76.53 
 
 
415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  65.93 
 
 
460 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  64.53 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  62.91 
 
 
412 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  59.17 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  56.77 
 
 
423 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  54.19 
 
 
420 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  58.58 
 
 
415 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  49.5 
 
 
419 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  55.17 
 
 
410 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  52.02 
 
 
406 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  48.09 
 
 
421 aa  360  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  52.08 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  57.78 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  50.26 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  52.13 
 
 
399 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  52 
 
 
431 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.52 
 
 
405 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  46.59 
 
 
418 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.38 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  46.99 
 
 
521 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  50.73 
 
 
413 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.15 
 
 
400 aa  309  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.64 
 
 
423 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  46.93 
 
 
408 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  51.14 
 
 
404 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.54 
 
 
408 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  46.25 
 
 
405 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  43.14 
 
 
409 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  40.15 
 
 
410 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  45.52 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  41.15 
 
 
405 aa  282  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  43.18 
 
 
419 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  44.22 
 
 
421 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  31.89 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.06 
 
 
416 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  33.85 
 
 
419 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  29.83 
 
 
397 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.62 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 
506 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.84 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.29 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  26.53 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29.91 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.98 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  32.29 
 
 
480 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.6 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 
536 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.4 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.61 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  29.84 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 
486 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0596  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  25.39 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.77 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.93 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  26.04 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.61 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.94 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.35 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  25.65 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
505 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.36 
 
 
530 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
503 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  27.02 
 
 
479 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.08 
 
 
368 aa  67  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
540 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  26.16 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.45 
 
 
505 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.77 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  30.33 
 
 
487 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  26.32 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  29.85 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  22.43 
 
 
544 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
546 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  26.55 
 
 
509 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
555 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.35 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.35 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  27.35 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.35 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.06 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
535 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  27.45 
 
 
556 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 
548 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>