More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3170 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  809    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  59.55 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  52.97 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  57.71 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  52.85 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  52.51 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  56.93 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  53.79 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  55.56 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  49.75 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  54.32 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  51.39 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  52.75 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  53.94 
 
 		 410 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  52.14 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  52.02 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  50.66 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  48.88 
 
 		 423 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  50.26 
 
 		 405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  51.17 
 
 		 521 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  50.37 
 
 		 415 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  50.25 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  50.51 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  45.96 
 
 		 409 aa  345  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  50.25 
 
 		 405 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49.88 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  49.35 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  49.88 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  48.64 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  42.07 
 
 		 410 aa  331  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  47.89 
 
 		 420 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  49.02 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  46.53 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  49.5 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  46.75 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  37.43 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  33.13 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.52 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.67 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.12 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.76 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  31.61 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  30.63 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.85 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  27.39 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.14 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  32.58 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  31.44 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.31 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.91 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  26.9 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.75 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.75 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  28.25 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.2 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.2 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.2 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  29.32 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  26.19 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  24.43 
 
 		 600 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.21 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  28.39 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  29.57 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.62 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.87 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  26.61 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  26.17 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1558  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.48 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00285508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29.94 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  28.34 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  30.74 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  24.58 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.99 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  25.99 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.99 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  25.99 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.74 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.07 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  26.26 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  26.44 
 
 		 630 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  26.54 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.54 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.38 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  26.17 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  29.49 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.03 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.48 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.5 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.5 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.5 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  29.47 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  24.76 
 
 		 555 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>