More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0304 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  75.85 
 
 
425 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  66.91 
 
 
460 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  63.91 
 
 
412 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  64.62 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  59.12 
 
 
416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  57.28 
 
 
423 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  60.64 
 
 
415 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  57.64 
 
 
410 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  51.84 
 
 
420 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  50.89 
 
 
406 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  47.74 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.97 
 
 
421 aa  343  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  60.06 
 
 
383 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  46.73 
 
 
418 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  49.25 
 
 
405 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  52.44 
 
 
413 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  49.51 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  51.51 
 
 
399 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  48.83 
 
 
391 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.15 
 
 
400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  50.63 
 
 
405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  45.84 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  46.19 
 
 
521 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  44 
 
 
423 aa  298  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.06 
 
 
408 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  44.5 
 
 
405 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  49.57 
 
 
404 aa  289  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  44.82 
 
 
408 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  41.29 
 
 
405 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  41.77 
 
 
409 aa  276  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  43.9 
 
 
414 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  38.89 
 
 
410 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  41.81 
 
 
419 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  41.96 
 
 
421 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  30.63 
 
 
404 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  32.04 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  29.74 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  32.22 
 
 
408 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.24 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 
540 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.08 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0079  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  27.97 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0535408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0596  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.68 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2117  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.47 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  30 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 
535 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.67 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0088  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  29.26 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 
630 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1969  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.656883  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.48 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.89 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  25.9 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  23.73 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.73 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29.25 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0057  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase / 2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  26.69 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.680846  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  24.85 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.45 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.24 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.72 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0267  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  27.36 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192574  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2897  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  27.62 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0358307  normal  0.859236 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2543  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  30.1 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  27.58 
 
 
486 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.17 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.05 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.51 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  27.3 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.75 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  28.18 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  26.18 
 
 
512 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  28.18 
 
 
499 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1827  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.36 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.61 
 
 
470 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 
480 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2145  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.02 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.66 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  28.09 
 
 
486 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
493 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.27 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 
531 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  28.89 
 
 
526 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 
486 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00851  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.22 
 
 
390 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  25.43 
 
 
574 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>