More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2327 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  839    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  72.66 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  71.82 
 
 		 421 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  59.45 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  60.05 
 
 		 405 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  56.93 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  55.42 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  55.3 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  47.16 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  46.44 
 
 		 408 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.63 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  49.62 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  49.88 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  41.46 
 
 		 521 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  47.07 
 
 		 391 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.19 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  48.11 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  47.65 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.3 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  46.5 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  45.52 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  43.65 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  43.32 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  46.35 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  44.22 
 
 		 410 aa  312  6.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  42.64 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  46.1 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  45.66 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  44.23 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.69 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  45.57 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  43.04 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  44.17 
 
 		 413 aa  285  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  42.62 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  46.44 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  37.53 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  32.28 
 
 		 404 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  33.96 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  35.2 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 		 537 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  28.88 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  27.88 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.8 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  26.52 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  30.29 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 596 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.94 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.77 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  26.12 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  27.33 
 
 		 508 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  25 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.57 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  29.77 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.55 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  24.77 
 
 		 535 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  26.47 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  27.64 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  25.45 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  26.45 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  28.66 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  26.18 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.53 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.71 
 
 		 506 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  28.27 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  24.74 
 
 		 575 aa  66.2  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  24.05 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  25 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  25 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.18 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  25.22 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  27.57 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  25.61 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  26.72 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  26.8 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>