More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2320 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  87.29 
 
 		 419 aa  736    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  862    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  52.85 
 
 		 406 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  52.99 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  52.87 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  48.17 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.85 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  48.09 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.39 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  47.74 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  42.69 
 
 		 521 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  46.62 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  46.35 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  48.87 
 
 		 412 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  49.62 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  46.77 
 
 		 391 aa  350  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  44.36 
 
 		 405 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  44.22 
 
 		 409 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  47.07 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  44.47 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  47.1 
 
 		 405 aa  336  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  47.12 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  46.1 
 
 		 421 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  46.63 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  46.38 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  42.11 
 
 		 410 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  46.23 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  45.96 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  44.25 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  45 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  46.65 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  46.23 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  44.8 
 
 		 420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  45.6 
 
 		 408 aa  282  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  46.67 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 		 416 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  31.68 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  29.83 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.87 
 
 		 506 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.41 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.84 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  26.63 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  25.47 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.57 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  26.88 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.22 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  25.78 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  24.68 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.79 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.62 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  26.07 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  24.88 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  26.18 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  23.94 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  25 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  27.08 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  27.08 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  25.81 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 		 503 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  26.8 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  26.22 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  22.78 
 
 		 566 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.2 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  26.01 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  26.88 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.33 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  26.33 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  26.91 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  26.33 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  25.95 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  25.68 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  23.82 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.59 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  27.97 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.07 
 
 		 529 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.06 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  25.93 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  24.71 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.05 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  27.39 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.77 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.15 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  25.57 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11206  FAD-dependent monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02380)  25.4 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0213132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  26.8 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.17 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  25.73 
 
 		 477 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  23.06 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  24.31 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.49 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  26.58 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.21 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.48 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.21 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.21 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>