More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4043 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  85.71 
 
 
395 aa  711    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
396 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.74 
 
 
397 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.02 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.7 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.3 
 
 
391 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.78 
 
 
390 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.15 
 
 
394 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
395 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
392 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
392 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.7 
 
 
408 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.46 
 
 
408 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.97 
 
 
400 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.39 
 
 
389 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.7 
 
 
410 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
392 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.92 
 
 
407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.39 
 
 
389 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.2 
 
 
398 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.99 
 
 
389 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.95 
 
 
410 aa  343  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.18 
 
 
410 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.92 
 
 
410 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.18 
 
 
410 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.18 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.18 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.92 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.39 
 
 
395 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.96 
 
 
413 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.96 
 
 
413 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.96 
 
 
413 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.96 
 
 
413 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.96 
 
 
413 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.64 
 
 
390 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.41 
 
 
407 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.47 
 
 
389 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.99 
 
 
391 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.56 
 
 
389 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.64 
 
 
390 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.13 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.38 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.99 
 
 
389 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.22 
 
 
389 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.5 
 
 
390 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.19 
 
 
390 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.22 
 
 
391 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.38 
 
 
389 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.64 
 
 
399 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.62 
 
 
394 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.93 
 
 
389 aa  322  9.000000000000001e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.62 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.99 
 
 
397 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.38 
 
 
392 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.67 
 
 
391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.97 
 
 
407 aa  318  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.87 
 
 
391 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.22 
 
 
390 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.08 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.41 
 
 
390 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.87 
 
 
394 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.85 
 
 
389 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.54 
 
 
395 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.53 
 
 
389 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  44.1 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.05 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.79 
 
 
401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.54 
 
 
395 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.5 
 
 
404 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.03 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.33 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.67 
 
 
400 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.74 
 
 
396 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.77 
 
 
421 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.67 
 
 
405 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.26 
 
 
390 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.78 
 
 
400 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.1 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.09 
 
 
402 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.15 
 
 
318 aa  282  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.9 
 
 
389 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.05 
 
 
390 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  35.42 
 
 
396 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
570 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  45.16 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  26.63 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  26.49 
 
 
525 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  27.87 
 
 
506 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  24.78 
 
 
531 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  24.25 
 
 
564 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  25.57 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.6 
 
 
542 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.6 
 
 
542 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  24.87 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>