More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1565 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  61.43 
 
 
460 aa  487  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  60.6 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  61.44 
 
 
417 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  56.77 
 
 
425 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  58.37 
 
 
416 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  57.32 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  51.95 
 
 
420 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  62.8 
 
 
383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  53.27 
 
 
410 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  49.02 
 
 
406 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46.52 
 
 
419 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  51.11 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  51.13 
 
 
431 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  52.44 
 
 
415 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  50.13 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  47.28 
 
 
418 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  45 
 
 
421 aa  319  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.25 
 
 
405 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  48.06 
 
 
423 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  50.37 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.23 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  49.88 
 
 
413 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  46.68 
 
 
400 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  41.52 
 
 
408 aa  293  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  46 
 
 
405 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  45.74 
 
 
521 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  41.71 
 
 
410 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.89 
 
 
408 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  42.32 
 
 
409 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  45.96 
 
 
405 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  45.57 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  41.04 
 
 
419 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  45.15 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  43.73 
 
 
421 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.22 
 
 
416 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  28.01 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  31.92 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.97 
 
 
408 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
506 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  30.09 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  30.19 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.19 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  31.42 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  26.53 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  29.12 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.61 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.39 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04002  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09540)  28.75 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.455437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.71 
 
 
475 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  30.07 
 
 
630 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.68 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  30.87 
 
 
479 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.49 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  26.49 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.98 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.49 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.03 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.68 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.41 
 
 
504 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.9 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.16 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  28.26 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  28.26 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  28.26 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0596  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.3 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.97 
 
 
510 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.73 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  27.73 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.22 
 
 
537 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  27.73 
 
 
554 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.27 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.93 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  25.92 
 
 
600 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.81 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.62 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  28.49 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  27.58 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.73 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.73 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.73 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  23.4 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>