More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1747 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  845    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  34.72 
 
 
404 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  34.4 
 
 
423 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  34.44 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  30.53 
 
 
419 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  34.97 
 
 
412 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  34.56 
 
 
460 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  30.66 
 
 
410 aa  166  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  33.85 
 
 
425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.81 
 
 
405 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  32.63 
 
 
418 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  33.66 
 
 
431 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  34.02 
 
 
408 aa  156  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  35.12 
 
 
405 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  30.41 
 
 
409 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  32.92 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  35.06 
 
 
413 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.36 
 
 
416 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  32.54 
 
 
400 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  33.96 
 
 
420 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  33.94 
 
 
417 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  30.9 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  30.81 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  32.95 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  32.91 
 
 
416 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  35.17 
 
 
405 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  30.43 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  33.89 
 
 
391 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  35.31 
 
 
421 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  30.41 
 
 
399 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  30.77 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  32.49 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  31.46 
 
 
423 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  32.37 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.93 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  24.59 
 
 
566 aa  80.5  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  28.21 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.02 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.24 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
548 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  26.93 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  27.99 
 
 
611 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  26.09 
 
 
574 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  26.79 
 
 
503 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.56 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  24.58 
 
 
511 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  25.08 
 
 
571 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  25.52 
 
 
574 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.1 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  25.95 
 
 
548 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  25.34 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  26.82 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.74 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.12 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.12 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  25.54 
 
 
534 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  24.66 
 
 
537 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  24.66 
 
 
537 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  24.72 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  24.66 
 
 
537 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  25.32 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  27.76 
 
 
538 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  27.76 
 
 
538 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.23 
 
 
508 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  26.73 
 
 
540 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
475 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  26.99 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  25.69 
 
 
549 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  26.11 
 
 
548 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  25 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  25.94 
 
 
530 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  26.11 
 
 
548 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  26.63 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  26.63 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  21.41 
 
 
544 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  26.63 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 
525 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  26.2 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  25.33 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.12 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 
430 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  27.55 
 
 
506 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  26.36 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  26.36 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  26.36 
 
 
388 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
511 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>