More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1232 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
417 aa  819    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  71.68 
 
 
412 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  65.02 
 
 
460 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  64.48 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  64.41 
 
 
416 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  65.65 
 
 
415 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  61.56 
 
 
423 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  54.17 
 
 
420 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  58.6 
 
 
415 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  54.88 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  49.88 
 
 
406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  54.4 
 
 
391 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46.53 
 
 
419 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  50.26 
 
 
405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  52.88 
 
 
405 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  59.56 
 
 
383 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  53.03 
 
 
413 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.23 
 
 
421 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  47.47 
 
 
418 aa  322  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  49.05 
 
 
431 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  50.75 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  55.11 
 
 
408 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  47.47 
 
 
405 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.24 
 
 
423 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  43.47 
 
 
409 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  45.67 
 
 
400 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  39.95 
 
 
410 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  47 
 
 
521 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.21 
 
 
405 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  45.3 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  41.44 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  41.03 
 
 
408 aa  283  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  46.1 
 
 
414 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  43.18 
 
 
419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  45.36 
 
 
421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  38.79 
 
 
416 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  28.64 
 
 
404 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  32.69 
 
 
419 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  29.78 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.91 
 
 
506 aa  92.8  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.79 
 
 
475 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  31.21 
 
 
489 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
422 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  30.37 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.47 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  30.36 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  29.09 
 
 
499 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.44 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 
630 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.93 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  29.62 
 
 
488 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.95 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  25.99 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  24.33 
 
 
600 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  26.49 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.94 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.81 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 
486 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  29.02 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.86 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  26.81 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  27.99 
 
 
511 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.04 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  25.52 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
417 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.77 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  25.14 
 
 
512 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.48 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.14 
 
 
537 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  24.53 
 
 
553 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  25.93 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  29.67 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  21.55 
 
 
598 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  29.17 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 
509 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
536 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  23.88 
 
 
529 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  28.74 
 
 
494 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 
489 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.02 
 
 
480 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.08 
 
 
391 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
455 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.26 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  23.99 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  25.58 
 
 
511 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 
505 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  24.69 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  25.62 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  28.27 
 
 
526 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.44 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1109  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.46 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.666485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>