More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3851 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
397 aa  822    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.74 
 
 
396 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.22 
 
 
395 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.35 
 
 
391 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.68 
 
 
392 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.67 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.42 
 
 
392 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.42 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.33 
 
 
392 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.58 
 
 
390 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.69 
 
 
395 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.66 
 
 
408 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.43 
 
 
410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.55 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.42 
 
 
400 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.9 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.66 
 
 
395 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.08 
 
 
410 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.44 
 
 
389 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.95 
 
 
392 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.04 
 
 
410 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.04 
 
 
410 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.04 
 
 
410 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.41 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.27 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
392 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.27 
 
 
410 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.27 
 
 
410 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
413 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
413 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
413 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
413 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
407 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.15 
 
 
413 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.1 
 
 
398 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.13 
 
 
389 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.93 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.22 
 
 
391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.52 
 
 
391 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.99 
 
 
389 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.61 
 
 
407 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.82 
 
 
401 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.59 
 
 
389 aa  323  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.08 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.96 
 
 
389 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.33 
 
 
389 aa  318  9e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.71 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.31 
 
 
389 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.94 
 
 
390 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.69 
 
 
389 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.28 
 
 
394 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.26 
 
 
390 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.01 
 
 
389 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.31 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.92 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.6 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.18 
 
 
394 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.03 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.51 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.05 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.49 
 
 
399 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.03 
 
 
390 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.16 
 
 
318 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.18 
 
 
394 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.07 
 
 
397 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.66 
 
 
395 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.65 
 
 
404 aa  298  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.28 
 
 
389 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.33 
 
 
389 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  41.69 
 
 
394 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.9 
 
 
395 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.69 
 
 
395 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.66 
 
 
390 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.41 
 
 
395 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.74 
 
 
394 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  38.04 
 
 
400 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.64 
 
 
421 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.22 
 
 
396 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.48 
 
 
390 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.9 
 
 
405 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.03 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  37.95 
 
 
389 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  38.44 
 
 
400 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  39.95 
 
 
402 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  32.87 
 
 
396 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  48.39 
 
 
178 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  28.12 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  24.38 
 
 
547 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  25.61 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  25 
 
 
514 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  26.02 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  24.31 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  25.22 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  25.88 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  26.54 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  25.88 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  24.48 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  26.54 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  26.04 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  23.68 
 
 
554 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>