More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7610 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
392 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  76.79 
 
 
400 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  62.82 
 
 
408 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  62.82 
 
 
408 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.54 
 
 
391 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.36 
 
 
410 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.73 
 
 
407 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.54 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.75 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.01 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.44 
 
 
410 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.69 
 
 
410 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.34 
 
 
410 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.34 
 
 
410 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.69 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.76 
 
 
407 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.51 
 
 
413 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.51 
 
 
413 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.25 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.77 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.25 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.25 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.27 
 
 
392 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.25 
 
 
413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.99 
 
 
394 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.78 
 
 
395 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.51 
 
 
395 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.83 
 
 
397 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.73 
 
 
392 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.24 
 
 
389 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.41 
 
 
392 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.83 
 
 
394 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  54.34 
 
 
394 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.34 
 
 
394 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.83 
 
 
394 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.56 
 
 
390 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.56 
 
 
391 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.94 
 
 
393 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.47 
 
 
390 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.28 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.78 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.93 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.9 
 
 
395 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.65 
 
 
421 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.15 
 
 
391 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.03 
 
 
391 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.96 
 
 
390 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.81 
 
 
395 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.92 
 
 
391 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.56 
 
 
390 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.33 
 
 
391 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.47 
 
 
389 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.42 
 
 
399 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.54 
 
 
390 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.05 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.03 
 
 
389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.62 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.03 
 
 
389 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.12 
 
 
389 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.13 
 
 
389 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.65 
 
 
401 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.82 
 
 
389 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.38 
 
 
390 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.29 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
389 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.62 
 
 
400 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.26 
 
 
390 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50 
 
 
390 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.44 
 
 
390 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.4 
 
 
405 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.26 
 
 
390 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
389 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
389 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.05 
 
 
390 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
396 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.46 
 
 
389 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.7 
 
 
396 aa  363  4e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.85 
 
 
404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.84 
 
 
395 aa  358  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.95 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.56 
 
 
389 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
402 aa  343  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.01 
 
 
400 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.53 
 
 
318 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  36.36 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  56.84 
 
 
178 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.7 
 
 
489 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.65 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.86 
 
 
497 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.82 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  28 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  27.37 
 
 
489 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
595 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  27.07 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.98 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.1 
 
 
475 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  25.91 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>