96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2384 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  173  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.267865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.26 
 
 		 393 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 410 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.95 
 
 		 410 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.95 
 
 		 410 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.95 
 
 		 410 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.89 
 
 		 410 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.51 
 
 		 389 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.89 
 
 		 410 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 407 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.95 
 
 		 410 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.32 
 
 		 391 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.14 
 
 		 390 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 413 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 407 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 413 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 413 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 413 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 407 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 		 413 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.74 
 
 		 392 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.79 
 
 		 391 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.45 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.68 
 
 		 401 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.06 
 
 		 398 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.38 
 
 		 390 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.79 
 
 		 400 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.99 
 
 		 389 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.35 
 
 		 392 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.06 
 
 		 389 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.91 
 
 		 390 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.84 
 
 		 392 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.06 
 
 		 390 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.63 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.38 
 
 		 390 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.38 
 
 		 389 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.32 
 
 		 389 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.19 
 
 		 392 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.32 
 
 		 389 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  53.68 
 
 		 394 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.26 
 
 		 392 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.19 
 
 		 391 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.63 
 
 		 394 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.87 
 
 		 389 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.58 
 
 		 394 aa  104  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.17 
 
 		 394 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.55 
 
 		 390 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.37 
 
 		 394 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.58 
 
 		 397 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.63 
 
 		 394 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.06 
 
 		 391 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.13 
 
 		 410 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.31 
 
 		 389 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.53 
 
 		 395 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.54 
 
 		 399 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.58 
 
 		 394 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.94 
 
 		 408 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.06 
 
 		 390 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.13 
 
 		 395 aa  97.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.94 
 
 		 408 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.81 
 
 		 407 aa  97.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.24 
 
 		 389 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.06 
 
 		 391 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.06 
 
 		 390 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.31 
 
 		 389 aa  95.5  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50 
 
 		 391 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.16 
 
 		 389 aa  94.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.96 
 
 		 395 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.39 
 
 		 397 aa  90.9  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.81 
 
 		 390 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.88 
 
 		 395 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2376  hypothetical protein  52.38 
 
 		 89 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2579  hypothetical protein  53.01 
 
 		 88 aa  89  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0429  hypothetical protein  49.44 
 
 		 91 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.364173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.74 
 
 		 389 aa  88.6  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.74 
 
 		 390 aa  89  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2437  hypothetical protein  53.01 
 
 		 100 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.88 
 
 		 395 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2532  hypothetical protein  53.01 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2447  hypothetical protein  53.01 
 
 		 96 aa  87.8  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.333595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.88 
 
 		 421 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2796  hypothetical protein  51.19 
 
 		 89 aa  87  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2935  IS1 related protein  52.44 
 
 		 86 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0804  hypothetical protein  52.44 
 
 		 111 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.767078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.16 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.39 
 
 		 405 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.09 
 
 		 395 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.21 
 
 		 389 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  40.66 
 
 		 400 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.74 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  33.66 
 
 		 400 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  35.64 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2594  hypothetical protein  50.72 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.72 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  36.84 
 
 		 396 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>