More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2230 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
392 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  95.92 
 
 
394 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  83.94 
 
 
390 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  75.84 
 
 
392 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  63.99 
 
 
392 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.43 
 
 
391 aa  501  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.31 
 
 
408 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  62.09 
 
 
410 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.08 
 
 
408 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.51 
 
 
395 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.13 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.87 
 
 
395 aa  465  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.4 
 
 
391 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.05 
 
 
392 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.64 
 
 
407 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.13 
 
 
410 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.38 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.1 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.38 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.38 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.38 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.1 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.38 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.58 
 
 
410 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.1 
 
 
410 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.13 
 
 
413 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.1 
 
 
410 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.1 
 
 
410 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.73 
 
 
392 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.67 
 
 
389 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.96 
 
 
400 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.93 
 
 
391 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.32 
 
 
390 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.97 
 
 
389 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.09 
 
 
390 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.61 
 
 
393 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.84 
 
 
391 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.42 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.09 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.9 
 
 
395 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.68 
 
 
389 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.97 
 
 
390 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.06 
 
 
394 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.92 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.87 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.43 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.65 
 
 
389 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.29 
 
 
391 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.42 
 
 
389 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.42 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  51.55 
 
 
394 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
401 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.8 
 
 
389 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
390 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.13 
 
 
395 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
389 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
394 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.87 
 
 
395 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.41 
 
 
405 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.87 
 
 
389 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.16 
 
 
394 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.26 
 
 
390 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.35 
 
 
389 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.74 
 
 
390 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.1 
 
 
395 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.48 
 
 
390 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.03 
 
 
389 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.97 
 
 
394 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.8 
 
 
391 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.71 
 
 
390 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.07 
 
 
395 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  48.99 
 
 
407 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  47.56 
 
 
421 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.45 
 
 
400 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50 
 
 
390 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.7 
 
 
396 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.48 
 
 
390 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.22 
 
 
318 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.34 
 
 
404 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  46.51 
 
 
389 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  43.99 
 
 
402 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.34 
 
 
400 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  33.16 
 
 
396 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  53.26 
 
 
178 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  26.91 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
561 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  25.06 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 
605 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
595 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  24.5 
 
 
585 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  25.86 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.22 
 
 
622 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.02 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.43 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>