More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03050 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1907  p-hydroxybenzoate hydroxylase  78.68 
 
 
394 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0133295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3500  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  78.17 
 
 
394 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.835067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0332  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  94.42 
 
 
394 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03050  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  100 
 
 
394 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00335247  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  75.38 
 
 
395 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  74.87 
 
 
397 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2387  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  74.87 
 
 
395 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.665407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  76.08 
 
 
394 aa  616  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3537  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  74.87 
 
 
395 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2237  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  74.87 
 
 
421 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0347  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  75.89 
 
 
395 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1983  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  72.05 
 
 
390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  70.77 
 
 
390 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0707  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  67.92 
 
 
400 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531901  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  70.77 
 
 
389 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  68.72 
 
 
389 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  67.43 
 
 
393 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  68.38 
 
 
391 aa  554  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1901  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.52 
 
 
394 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.213246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4018  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  66.49 
 
 
398 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.87 
 
 
390 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.64 
 
 
390 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.21 
 
 
401 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3893  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.34 
 
 
404 aa  528  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3474  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  63.33 
 
 
390 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  64.3 
 
 
399 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3723  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  62.05 
 
 
389 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  63.08 
 
 
389 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  63.08 
 
 
389 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6123  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  65.9 
 
 
390 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66418  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.77 
 
 
390 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  63.24 
 
 
389 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2710  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.28 
 
 
390 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.44 
 
 
391 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4161  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60 
 
 
389 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.314904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0561  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.26 
 
 
389 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.061935  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.7 
 
 
391 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  61.95 
 
 
390 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.93 
 
 
389 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.31 
 
 
389 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3479  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.21 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  60.51 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526509  normal  0.0118004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2447  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.65 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  59.23 
 
 
389 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329756  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4006  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57 
 
 
395 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2054  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  57.95 
 
 
408 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541897  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3157  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.98 
 
 
410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65281  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2242  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  58.16 
 
 
410 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5016  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.98 
 
 
410 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2458  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  56.78 
 
 
400 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00152384  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5114  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.47 
 
 
410 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.223132  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5745  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  55.47 
 
 
410 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758891  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4478  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.96 
 
 
410 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3130  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.45 
 
 
410 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.2 
 
 
407 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1199  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.71 
 
 
413 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4456  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.32 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459357 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0053  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.96 
 
 
413 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0066  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.96 
 
 
413 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469601  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5289  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.45 
 
 
410 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0045  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.71 
 
 
407 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1551  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.71 
 
 
407 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0055  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.71 
 
 
413 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1482  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  54.71 
 
 
413 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7610  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.83 
 
 
392 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4014  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.71 
 
 
390 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.13 
 
 
392 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1625  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  53.69 
 
 
395 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2040  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.8 
 
 
394 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2230  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.06 
 
 
392 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5490  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.52 
 
 
392 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1564  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  52.55 
 
 
391 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0892208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1534  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.52 
 
 
405 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  0.0830995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4886  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.37 
 
 
407 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.879694  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1850  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  51.91 
 
 
396 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2831  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.36 
 
 
391 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.543631  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.77 
 
 
389 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26690  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  49.23 
 
 
391 aa  360  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140669  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.38 
 
 
395 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  45.13 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5420  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  42.86 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3851  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  41.18 
 
 
397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000154299  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2682  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  44.87 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0923834 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  50.5 
 
 
318 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  35.36 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2384  hypothetical protein  52.63 
 
 
178 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.96 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  25.97 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.67 
 
 
497 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  24.61 
 
 
506 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  24.39 
 
 
557 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 
547 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.82 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  26.39 
 
 
556 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.55 
 
 
542 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.55 
 
 
542 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.92 
 
 
489 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  27.03 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  27.03 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>