More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1366 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  839    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  59.55 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  53.01 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  57.86 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  52.99 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  50.25 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  52.14 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  52.55 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  55.42 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  50.25 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  51.29 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.77 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  49.09 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  53.54 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.12 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  50.89 
 
 		 412 aa  355  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  50.37 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  48.64 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  43.8 
 
 		 521 aa  346  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  49.62 
 
 		 431 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  50.5 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  46.06 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  47.26 
 
 		 415 aa  329  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  49.62 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  45.57 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  44.33 
 
 		 410 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  46.59 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  47.69 
 
 		 408 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  51.16 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  47.63 
 
 		 413 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  46.13 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  47.47 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  46.45 
 
 		 415 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  47.28 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  48.81 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  37.04 
 
 		 416 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  30.6 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.32 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4474  salicylate hydroxylase protein  29.97 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  27.79 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  29.39 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.33 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.61 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  24.88 
 
 		 600 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.49 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.69 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  23.84 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  26.75 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.79 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.99 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  25.24 
 
 		 497 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  24.54 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  27.55 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  25.83 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.93 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.16 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  28.57 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  26.44 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.95 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  25.91 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  27.51 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  27.71 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.53 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  23.32 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  24.07 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  25.49 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  25.73 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.65 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.57 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.27 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  28.44 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  24.94 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  26.96 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  32.39 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  26.06 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  30.43 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>