More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1983 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  59.7 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  53.88 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  47.17 
 
 		 421 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46.98 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  49.62 
 
 		 418 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  50.25 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49.13 
 
 		 405 aa  352  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  52.26 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51 
 
 		 405 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  52.25 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  49.61 
 
 		 391 aa  332  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  54.64 
 
 		 413 aa  329  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  52.75 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.18 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  50.51 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  46.63 
 
 		 460 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  50.26 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  50.25 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  47.04 
 
 		 420 aa  313  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  49.75 
 
 		 417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.23 
 
 		 423 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  45.34 
 
 		 405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  46.8 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  42.89 
 
 		 405 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  47.65 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  49 
 
 		 416 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  48.88 
 
 		 415 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  42.36 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  44.23 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  41.67 
 
 		 410 aa  290  5.0000000000000004e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  45.36 
 
 		 419 aa  289  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  46.65 
 
 		 404 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  52.75 
 
 		 383 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  35.43 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  31.03 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  32.91 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.22 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  26.71 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.41 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  32.47 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.17 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  30.51 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.48 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.7 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  34.01 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.13 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.84 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.73 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  28.44 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.85 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  29.65 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.56 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  29.57 
 
 		 968 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  28.03 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 553 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.15 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.53 
 
 		 546 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.57 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.19 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.63 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  24.52 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.95 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  28.09 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  30.06 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  31.55 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  31.55 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  30.91 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 		 630 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 576 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 		 531 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  25.29 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.41 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.23 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>