More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5898 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
408 aa  808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  52.35 
 
 
405 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  52.11 
 
 
412 aa  344  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  47.69 
 
 
418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  52.11 
 
 
399 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  48.85 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  51.27 
 
 
460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.9 
 
 
405 aa  325  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.75 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  50 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  48.76 
 
 
406 aa  318  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  51.27 
 
 
425 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  47.9 
 
 
423 aa  315  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  50 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  44.19 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  51.37 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  43.84 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  42.65 
 
 
408 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  51.43 
 
 
415 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  45.61 
 
 
409 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  41.63 
 
 
521 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  48.05 
 
 
415 aa  292  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  45.99 
 
 
405 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  41.98 
 
 
405 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  45.41 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  41.65 
 
 
421 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  50.45 
 
 
423 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  45.61 
 
 
420 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  51.72 
 
 
410 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  43.67 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  47.43 
 
 
404 aa  269  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  45.21 
 
 
414 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  48.44 
 
 
413 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  42.75 
 
 
419 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  46.75 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  41.1 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  30.39 
 
 
404 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.8 
 
 
419 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 
397 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.48 
 
 
503 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  25.62 
 
 
574 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.21 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.65 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.74 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  26.5 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.32 
 
 
511 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  28.53 
 
 
548 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 
518 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  25.62 
 
 
574 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  31.21 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.56 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  29.17 
 
 
611 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.27 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  28.15 
 
 
504 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.82 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  27.86 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 
630 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  24.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  30.24 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  29.62 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  24.27 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.85 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.85 
 
 
548 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.75 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.27 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.01 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.68 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.95 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  28.48 
 
 
538 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
564 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  28.48 
 
 
538 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.1 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  28.7 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  27 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  27.86 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  27 
 
 
553 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1558  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.74 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00285508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.26 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 
548 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  27.85 
 
 
548 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  27.66 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.1 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129538  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  23.32 
 
 
571 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.75 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 
501 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>