More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  100 
 
 		 416 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  67 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  64.13 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  60.73 
 
 		 460 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  59.17 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  58.84 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  58.51 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  59.86 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  54.15 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  53.51 
 
 		 410 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  50.5 
 
 		 418 aa  352  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  53.52 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  49.88 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.63 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  51.61 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  51.2 
 
 		 413 aa  318  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  51 
 
 		 399 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  47.19 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  44.25 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  48.76 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  47.78 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.67 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  46.63 
 
 		 521 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  46.13 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  57.86 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  42.3 
 
 		 408 aa  293  6e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  46.27 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  40.48 
 
 		 410 aa  282  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  41.19 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  44.5 
 
 		 405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  40.72 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  45.21 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  44.28 
 
 		 419 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  44.69 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  38.86 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  28.17 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  33.69 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  29.64 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.83 
 
 		 497 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.86 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.26 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  26.72 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.7 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  26.32 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  26.18 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.86 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  30.3 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.34 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  27.08 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  23.62 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1946  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.49 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0857423  hitchhiker  0.00135918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 536 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0603  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.7 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.862767  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.84 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.54 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.09 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.11 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.99 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.53 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  28.71 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  28.61 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  30.09 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  22.88 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  28.1 
 
 		 481 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  25.42 
 
 		 524 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.61 
 
 		 491 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.35 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.96 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.52 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  25.23 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.92 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.41 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2436  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.35 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.873151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  26.22 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  26.32 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.77 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.61 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  25.18 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3182  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.91 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.96 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  24.29 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.69 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0339  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.33 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.972507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.92 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2684  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.25 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  30.61 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  29.05 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0441  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.33 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 553 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  31.41 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>