More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0506 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  56.05 
 
 
412 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  52.91 
 
 
460 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  54.7 
 
 
416 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  54.26 
 
 
425 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  56.43 
 
 
415 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  54.15 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  51.79 
 
 
423 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  52.25 
 
 
415 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  52.77 
 
 
410 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  47.43 
 
 
406 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  48.09 
 
 
391 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  46.38 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.01 
 
 
405 aa  326  5e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46.29 
 
 
419 aa  326  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  49.52 
 
 
413 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  44.9 
 
 
408 aa  319  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  47.04 
 
 
431 aa  319  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  46.77 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  48.4 
 
 
405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  44.8 
 
 
421 aa  308  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  46.13 
 
 
399 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  42.05 
 
 
409 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  39.3 
 
 
410 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  45.1 
 
 
521 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  43.77 
 
 
423 aa  289  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  47.08 
 
 
404 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  43.41 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  44.28 
 
 
405 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  42.04 
 
 
405 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  52.3 
 
 
383 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  43.92 
 
 
419 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  49.55 
 
 
408 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  44.79 
 
 
414 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  44.83 
 
 
421 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.84 
 
 
416 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  27.46 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.37 
 
 
419 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 
506 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.2 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.11 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  25.3 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.68 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  24.33 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  24.82 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  23.6 
 
 
566 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  26.76 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3510  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  30.9 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0224516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  25.37 
 
 
486 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.63 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 
480 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  25.97 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  24.82 
 
 
414 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2055  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  27.1 
 
 
414 aa  63.2  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997831  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.46 
 
 
422 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  25.49 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  30.85 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  26.03 
 
 
481 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.3 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  26.57 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  26.3 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.4 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
574 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  24.52 
 
 
531 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.8 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 
503 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1884  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.53 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.150769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 
571 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  22.56 
 
 
511 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.88 
 
 
543 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
553 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
553 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 
388 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.12 
 
 
390 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
553 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.34 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  24.57 
 
 
511 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.54 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  28.3 
 
 
489 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  27.54 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  26.93 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  28.44 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  25.83 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  28.37 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
555 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.54 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5431  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.0291121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
558 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
553 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.82 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  26.06 
 
 
497 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>