More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11769 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  928    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  65.93 
 
 
425 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  67.09 
 
 
415 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  64.25 
 
 
412 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  64.59 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  60.58 
 
 
416 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  61.43 
 
 
423 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  52.33 
 
 
420 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  56.07 
 
 
415 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  55.53 
 
 
410 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  51.39 
 
 
406 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  47.85 
 
 
419 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.62 
 
 
421 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  54.16 
 
 
405 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  51.44 
 
 
391 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  49.62 
 
 
405 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  57.32 
 
 
383 aa  334  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  47.1 
 
 
423 aa  328  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  45.57 
 
 
418 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  48.67 
 
 
399 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.35 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  51.93 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  43.69 
 
 
409 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  46.63 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.88 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  39.9 
 
 
410 aa  305  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  45.36 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  45.17 
 
 
521 aa  299  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  41.32 
 
 
405 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  43.22 
 
 
405 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  42.98 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  44.14 
 
 
404 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  43.65 
 
 
414 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  43.39 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  40.86 
 
 
419 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.89 
 
 
416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  31.15 
 
 
404 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.08 
 
 
419 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  31.14 
 
 
397 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 
408 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.01 
 
 
388 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.56 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.27 
 
 
506 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.32 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.55 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.24 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.96 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  27.01 
 
 
574 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 
630 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.24 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.24 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  24.24 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.24 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  24.24 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.04 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.24 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.94 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0628  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.22 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  27.05 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 
576 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.19 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.88 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.36 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.92 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3622  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.85 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  28.18 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0596  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.76 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.6 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 
571 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  24.85 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  27.76 
 
 
498 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.88 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.16 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  27.24 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
570 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.14 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0376  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.49 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  25.8 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  25.6 
 
 
537 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.96 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  23.66 
 
 
533 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  27.25 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  28.17 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  26.77 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.23 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.25 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>