More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1606 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
413 aa  807    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  58.8 
 
 
410 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  56.58 
 
 
405 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  54.59 
 
 
412 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  54.38 
 
 
391 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  54.99 
 
 
415 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  53.85 
 
 
399 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  52.72 
 
 
405 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  51.93 
 
 
460 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  54.39 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  47.63 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  50.73 
 
 
425 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  47.51 
 
 
419 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  49.5 
 
 
406 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  53.43 
 
 
417 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  52.13 
 
 
415 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  49.64 
 
 
420 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  51.2 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  47.41 
 
 
423 aa  329  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  47.15 
 
 
421 aa  328  8e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  45.75 
 
 
405 aa  322  9.000000000000001e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  44.79 
 
 
408 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  49.65 
 
 
423 aa  315  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  44.64 
 
 
409 aa  311  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  46.52 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  45.98 
 
 
405 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  40.94 
 
 
410 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  42.93 
 
 
419 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  50.31 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  43.89 
 
 
405 aa  282  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  44.42 
 
 
414 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  45.74 
 
 
404 aa  275  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  44.96 
 
 
521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  41.77 
 
 
421 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  55.97 
 
 
383 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  34.7 
 
 
416 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.29 
 
 
419 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  28.85 
 
 
404 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.28 
 
 
422 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.36 
 
 
389 aa  87.4  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.57 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.53 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.85 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.09 
 
 
535 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  31.37 
 
 
630 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  26.93 
 
 
540 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  28.36 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  30.06 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  26.57 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.33 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2992  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.24 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287088  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  28.31 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1532  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.44 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.367837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.11 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2055  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  28.08 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997831  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.87 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  27.08 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 
531 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1505  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.44 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  29.45 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  27.6 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.91 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  25.52 
 
 
566 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  28.48 
 
 
509 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  25.38 
 
 
537 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  29.41 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0628  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.34 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3583  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.01 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.114816  normal  0.502455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2382  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.27 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  28.12 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0268  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.95 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0654984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.35 
 
 
497 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7086  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.45 
 
 
391 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4358  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.2 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119328  normal  0.266581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2326  monooxygenase FAD-binding protein  23.63 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000156334  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4202  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  30.27 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1156  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  21.62 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 
486 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.35 
 
 
475 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  26.5 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  29.75 
 
 
617 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2117  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.19 
 
 
439 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  29.11 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  26.13 
 
 
505 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.04 
 
 
498 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5020  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  25.86 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.83 
 
 
509 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  24.71 
 
 
554 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  29.15 
 
 
547 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  24.09 
 
 
543 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  26.38 
 
 
504 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0641  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.05 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  24.49 
 
 
524 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>