More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2386 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
412 aa  813    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  71.46 
 
 
417 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  67.23 
 
 
416 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  64.48 
 
 
460 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  62.84 
 
 
425 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  64.38 
 
 
415 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  60.83 
 
 
423 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  60.48 
 
 
415 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  56.27 
 
 
420 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  57.04 
 
 
410 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  52.14 
 
 
406 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  54.21 
 
 
405 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  52.86 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  50.89 
 
 
418 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  48.24 
 
 
419 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  54.78 
 
 
413 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  55.14 
 
 
405 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  48.87 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  49.75 
 
 
405 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  50.61 
 
 
431 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  52.75 
 
 
399 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  50.87 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  47.89 
 
 
400 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  47.38 
 
 
423 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  46.23 
 
 
405 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  60.14 
 
 
383 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  49.62 
 
 
414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  44.06 
 
 
408 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  47.1 
 
 
419 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  47.92 
 
 
521 aa  305  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  44.47 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  40.7 
 
 
410 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  46.75 
 
 
421 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  43.04 
 
 
405 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  45.11 
 
 
404 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  32.52 
 
 
404 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  34.32 
 
 
419 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.46 
 
 
414 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  28.65 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.14 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  27.29 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.38 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  30.15 
 
 
505 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.98 
 
 
537 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.4 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  26.83 
 
 
540 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  28.27 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  28.27 
 
 
515 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.9 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.58 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  29.45 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 
531 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.23 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  27.25 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  25.7 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  24.58 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.05 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  26.67 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.98 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  29.82 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  28.53 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  29.87 
 
 
481 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  25.95 
 
 
503 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.18 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  28.14 
 
 
501 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  28.49 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  27.58 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03536  FAD monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00140)  23.24 
 
 
643 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  25.35 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.43 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  27.32 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  29.06 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 
547 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  30.21 
 
 
496 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.16 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  25.24 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14390  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.51 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.74 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3846  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.9 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.22 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 
533 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  26.97 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 
478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.32 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>