More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0456 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  788    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  57.43 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  55.56 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  49.63 
 
 
418 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  48.12 
 
 
419 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  46.65 
 
 
421 aa  358  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  48.15 
 
 
399 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  48.74 
 
 
431 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  48.5 
 
 
412 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  44.39 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  48.97 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47.19 
 
 
405 aa  326  5e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  46.97 
 
 
405 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  46.02 
 
 
460 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  48.72 
 
 
415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  47.35 
 
 
421 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  45.92 
 
 
419 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  48.74 
 
 
405 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  42.42 
 
 
409 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  46.25 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  48.51 
 
 
410 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  47.63 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  44.47 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  41.24 
 
 
521 aa  310  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.76 
 
 
423 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  47.39 
 
 
415 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  47 
 
 
416 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  46.53 
 
 
423 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  46.35 
 
 
417 aa  292  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  44.61 
 
 
420 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  38.89 
 
 
410 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  45.1 
 
 
413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  45.81 
 
 
408 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  45.67 
 
 
383 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.1 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  27.34 
 
 
404 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  32.54 
 
 
419 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.68 
 
 
497 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
506 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.08 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.24 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.86 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  27.65 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  24.12 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.55 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  27.71 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  26.04 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  26.53 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0232  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  35.68 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.73 
 
 
510 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  25.95 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 
505 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  26.54 
 
 
537 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.07 
 
 
489 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
555 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0376  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  30.21 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.42 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  26.37 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  24.72 
 
 
514 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68955  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  31.47 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.17 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5964  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.8 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  22.28 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  30.54 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  25.33 
 
 
592 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.81 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  24.04 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  27.36 
 
 
419 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  25.44 
 
 
540 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0716  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.89 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000335906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 
542 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.02 
 
 
542 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  25.65 
 
 
489 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.29 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.89 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  27.75 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
554 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
545 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  27.75 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  27.75 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  26.97 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.14 
 
 
422 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 
477 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  28.75 
 
 
496 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  25.6 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  26.33 
 
 
630 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  27.38 
 
 
526 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_002978  WD0177  monoxygenase family protein  22.6 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  24.38 
 
 
479 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
579 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  24.86 
 
 
600 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.61 
 
 
391 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129538  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  25.48 
 
 
569 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
553 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
553 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
553 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>