More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6010 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 410 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  55.58 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  56.89 
 
 		 412 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  55.17 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  57.29 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  53.94 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  58.31 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  57.66 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  53.51 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  52.25 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  54.48 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  52.57 
 
 		 420 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  53.27 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  49.62 
 
 		 418 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  52.26 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  54.16 
 
 		 405 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  46.46 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.34 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  50.66 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  51.17 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  45.96 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  48.2 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  46.7 
 
 		 408 aa  306  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  44.53 
 
 		 419 aa  299  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  44.41 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  46.03 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  46.35 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  51.72 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  45.5 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  44 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  42.65 
 
 		 521 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  45.5 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  40 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  54.21 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  37.01 
 
 		 410 aa  252  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  36.22 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  29.86 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  32.24 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  26.53 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  27.72 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.69 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  28.96 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0592  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.54 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.53 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0628  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2506  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  27.66 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2514  monooxygenase FAD-binding protein  30.92 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  25.81 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.74 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  27.86 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07400  hypothetical protein  26.99 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  29.14 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0088  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  31.8 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  26.92 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  34.62 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0079  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  30.41 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0535408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  26.18 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1969  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.16 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.656883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 555 aa  63.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.55 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  24.94 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 545 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  27.33 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0327  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.53 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.65 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  29.07 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  27.83 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.42 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  23.89 
 
 		 539 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.72 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.86 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  25 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  25.53 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.72 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  26.99 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  24.62 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.72 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  24.72 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2503  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.6 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  24.36 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>