93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  100 
 
 
468 aa  953    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  50.86 
 
 
558 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  35.12 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  34.2 
 
 
469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  36.38 
 
 
444 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  35.38 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  35 
 
 
468 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  34.32 
 
 
463 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  35.08 
 
 
468 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  33.85 
 
 
460 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 
459 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  33.03 
 
 
436 aa  200  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  32.29 
 
 
463 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
460 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  34.81 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  29.8 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.91 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  35.43 
 
 
460 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  32.16 
 
 
458 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  33.41 
 
 
443 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  33.87 
 
 
447 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
477 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 
441 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  32.91 
 
 
447 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  32.91 
 
 
476 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  32.91 
 
 
447 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  29.05 
 
 
508 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  35.8 
 
 
452 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  35.66 
 
 
468 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  34.59 
 
 
460 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  34.51 
 
 
460 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  34.51 
 
 
460 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 
445 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
447 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  33.48 
 
 
460 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  36.84 
 
 
462 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  36.39 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  35.1 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  35.1 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  29.67 
 
 
490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  30.91 
 
 
446 aa  163  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  31.94 
 
 
460 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  31.84 
 
 
482 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  33.07 
 
 
447 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
509 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
531 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  27.82 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  34.44 
 
 
487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  32.13 
 
 
471 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  27.75 
 
 
440 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  26.9 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  26.67 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  26.67 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  26.9 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  26.67 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  30.53 
 
 
462 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  26.44 
 
 
440 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  25.86 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.11 
 
 
844 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 
469 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  28.49 
 
 
839 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
472 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  29.98 
 
 
497 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
500 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
446 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
476 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  26.92 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  27.96 
 
 
490 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  29.41 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.2 
 
 
405 aa  60.1  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  26.64 
 
 
406 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  59.57 
 
 
235 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  28.16 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
437 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  27.91 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
518 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  26.01 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.07 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  24.59 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  26.4 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  26.27 
 
 
411 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  24.42 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  28.23 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  24.56 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  25.6 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  30.66 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  26.98 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  26.91 
 
 
404 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  23.84 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>