78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0650 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
487 aa  945    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  45.93 
 
 
472 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  43.48 
 
 
509 aa  272  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  40.58 
 
 
484 aa  259  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  36.19 
 
 
460 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  32.1 
 
 
453 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  39.37 
 
 
482 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 
457 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  35.28 
 
 
459 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  36.22 
 
 
460 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  36.22 
 
 
460 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  36.22 
 
 
460 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 
477 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
471 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  31.77 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  35.27 
 
 
460 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  34.65 
 
 
460 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  29.59 
 
 
469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.15 
 
 
476 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  33.26 
 
 
449 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.21 
 
 
447 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.21 
 
 
447 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  33.41 
 
 
463 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  34.5 
 
 
444 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  32.95 
 
 
458 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  35.15 
 
 
460 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  30.8 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  31.86 
 
 
468 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 
443 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  26.2 
 
 
440 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  34.31 
 
 
468 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  26.2 
 
 
440 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  26.82 
 
 
440 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  31.63 
 
 
468 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  26.38 
 
 
440 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  26.38 
 
 
440 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  26.61 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  26.54 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  32.49 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  25.97 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
447 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  31.03 
 
 
460 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  26.92 
 
 
508 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 
446 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  31.41 
 
 
462 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  31.41 
 
 
462 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  31.09 
 
 
462 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  33.85 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  26.42 
 
 
440 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  25.91 
 
 
440 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 
445 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  33.33 
 
 
449 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  30.38 
 
 
558 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  29.14 
 
 
447 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  26.59 
 
 
441 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 
477 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  30.69 
 
 
462 aa  136  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
446 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
476 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.07 
 
 
844 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  23.09 
 
 
839 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  31.61 
 
 
497 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
500 aa  90.1  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  30.09 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
518 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
410 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  22.12 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  28.98 
 
 
434 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>