83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1719 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  917    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  35.76 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  35.65 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  34.87 
 
 
441 aa  282  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  36.53 
 
 
460 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  36.3 
 
 
460 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  32.88 
 
 
440 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  35.33 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  31.88 
 
 
440 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  31.88 
 
 
440 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  33.41 
 
 
460 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  33.26 
 
 
460 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  31.19 
 
 
440 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  31.36 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  246  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  34.01 
 
 
477 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  31.69 
 
 
457 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.35 
 
 
471 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  34.39 
 
 
463 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  33.33 
 
 
452 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  30.43 
 
 
440 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.89 
 
 
440 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  33.93 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  33.64 
 
 
443 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  32.87 
 
 
468 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
531 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  34.36 
 
 
468 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  35.91 
 
 
477 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  31.18 
 
 
459 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  32.05 
 
 
482 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  31.69 
 
 
458 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  31.19 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  30.75 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  31.53 
 
 
468 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  32.26 
 
 
443 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  34.79 
 
 
558 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  31.14 
 
 
460 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  31.14 
 
 
460 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  31.14 
 
 
460 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  32.64 
 
 
447 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  32.91 
 
 
468 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  30.23 
 
 
508 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
445 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  28.76 
 
 
490 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 
487 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  28.67 
 
 
839 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.41 
 
 
844 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  31.54 
 
 
462 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  31.54 
 
 
462 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
509 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  30.05 
 
 
462 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  29.95 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  30.43 
 
 
449 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
469 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
446 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  25.37 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  26.24 
 
 
497 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 
437 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  23.83 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  28.48 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.86 
 
 
429 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  24.76 
 
 
490 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25 
 
 
461 aa  46.6  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
430 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  22.8 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  25.54 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  22.4 
 
 
442 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>