75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1331 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  943    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  943    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  94.59 
 
 
462 aa  897    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  70.98 
 
 
449 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  69.33 
 
 
462 aa  631  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  41.78 
 
 
458 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  40.14 
 
 
460 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  40.14 
 
 
460 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  40.14 
 
 
460 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  34.86 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  35.7 
 
 
460 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  33.69 
 
 
460 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  34.01 
 
 
484 aa  210  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  34.67 
 
 
443 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  33.71 
 
 
460 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  33.1 
 
 
436 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  33.04 
 
 
459 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  35.96 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  33.57 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  33.56 
 
 
463 aa  193  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  30.19 
 
 
471 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  29.79 
 
 
469 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  32.06 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  30.39 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  31.44 
 
 
447 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  34.08 
 
 
477 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 
477 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
447 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  32.88 
 
 
468 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 
447 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  28.67 
 
 
457 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  35.14 
 
 
452 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  29.13 
 
 
508 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  31.39 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  30.93 
 
 
440 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.05 
 
 
440 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  31.8 
 
 
558 aa  167  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  30.66 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  30.83 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.05 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.05 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35.1 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 
531 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  29.52 
 
 
440 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.54 
 
 
447 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.54 
 
 
447 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.54 
 
 
476 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
469 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.77 
 
 
440 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  31.07 
 
 
446 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.59 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  28.93 
 
 
460 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  29.41 
 
 
440 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
445 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 
509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  31.41 
 
 
487 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 
460 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 
471 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.5 
 
 
844 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  25.85 
 
 
839 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
446 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
437 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  60.87 
 
 
235 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  25.94 
 
 
497 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
518 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  24.03 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.14 
 
 
405 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>