87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4358 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 447 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  46.51 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  42.89 
 
 		 484 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  33.11 
 
 		 469 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  36.59 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  36.75 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  33.6 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.19 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.19 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.19 
 
 		 476 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.35 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  39.1 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  36.6 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  36.6 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  36.6 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  32.44 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 		 445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  38.83 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  34.18 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  36.22 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  34.46 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  39.42 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  37.75 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  37.84 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  36.93 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  38.2 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  35.14 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  39.08 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  34.86 
 
 		 462 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  34.86 
 
 		 462 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  34.81 
 
 		 558 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  37.28 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 		 509 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  33.07 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  33.98 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  33.51 
 
 		 468 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  29.71 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  33.52 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  32.37 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 446 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  34.58 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  38.11 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  31.74 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  33.15 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  33.68 
 
 		 462 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  34.94 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  24.65 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  25.58 
 
 		 440 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  25.58 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  26.73 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  25.58 
 
 		 440 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  25.58 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  28.23 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  25.75 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  25.93 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  24.49 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  34.55 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.27 
 
 		 844 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  27.76 
 
 		 839 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  29.72 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  30.06 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  31.36 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  36.15 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  56.82 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  31.43 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  33.89 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  30.49 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  27.59 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  27.01 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  22.94 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  29.05 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  29.85 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  27.1 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>