76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1538 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
471 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 
444 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  38.84 
 
 
482 aa  246  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  38.36 
 
 
459 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  37.56 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  35.02 
 
 
436 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  34.47 
 
 
443 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  35.48 
 
 
449 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  35.84 
 
 
477 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 
463 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  35.68 
 
 
490 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  35.68 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  35.19 
 
 
447 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  35.78 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  36.88 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  34 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  33.64 
 
 
468 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  38.17 
 
 
468 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
531 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  35.01 
 
 
460 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  35.01 
 
 
460 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  35.01 
 
 
460 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  37.26 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  28.82 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  33.03 
 
 
468 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
447 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  29.28 
 
 
440 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  29.28 
 
 
440 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  33.06 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  30.65 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  28.93 
 
 
440 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  29.05 
 
 
440 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  33.03 
 
 
460 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  32.96 
 
 
460 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.08 
 
 
440 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.47 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.84 
 
 
440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 
453 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 
446 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  33.64 
 
 
449 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  29.55 
 
 
460 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
457 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  32.57 
 
 
468 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  27.79 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  30.26 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  32.35 
 
 
462 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  31.97 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  31.97 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  33.33 
 
 
462 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  35.11 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
558 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
445 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  27.33 
 
 
508 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  26.59 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  26.59 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  26.59 
 
 
476 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
472 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  27.13 
 
 
452 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.7 
 
 
844 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  27.13 
 
 
839 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
509 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
469 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  28.1 
 
 
497 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
518 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  31.82 
 
 
436 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  27.91 
 
 
507 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>