97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1239 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
484 aa  955    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  43.82 
 
 
469 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  41.13 
 
 
471 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  42.44 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  40.73 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  37.26 
 
 
457 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  41.36 
 
 
477 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  42.54 
 
 
444 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  41.54 
 
 
460 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  42.44 
 
 
460 aa  287  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  38.9 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  38.82 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  41.99 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  40.23 
 
 
449 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  37.14 
 
 
452 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 
447 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
445 aa  274  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  38.98 
 
 
460 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  41.49 
 
 
482 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  39.1 
 
 
459 aa  266  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  41.53 
 
 
460 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  41.31 
 
 
460 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  41.31 
 
 
460 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  37.87 
 
 
468 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  36.93 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  37.5 
 
 
443 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  42.89 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  33.18 
 
 
446 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  36.3 
 
 
463 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 
441 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  31.91 
 
 
508 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  39.34 
 
 
468 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  36.69 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  33.93 
 
 
447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  33.93 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35.12 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  33.93 
 
 
447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  40.58 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  36.05 
 
 
436 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  35.51 
 
 
558 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
531 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  36.61 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  33.71 
 
 
449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  33.71 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  35.38 
 
 
509 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  36.04 
 
 
477 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  34.01 
 
 
462 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  34.01 
 
 
462 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  33.93 
 
 
462 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  32.1 
 
 
490 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  29.55 
 
 
440 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  27.95 
 
 
440 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  29.16 
 
 
440 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  29.32 
 
 
440 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.64 
 
 
440 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
469 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  28.64 
 
 
440 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  28.64 
 
 
440 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.09 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.13 
 
 
844 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  32.86 
 
 
471 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  29.8 
 
 
839 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
446 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  29.46 
 
 
497 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
476 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 
518 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  62.22 
 
 
235 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  28 
 
 
490 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  27.09 
 
 
436 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  24.07 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
447 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
447 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  24.79 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  24.66 
 
 
416 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.85 
 
 
435 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  23.85 
 
 
435 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  23.78 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  23.56 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  23.5 
 
 
429 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  28.72 
 
 
436 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  24.07 
 
 
436 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1223  hypothetical protein  25.27 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417848  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  25.46 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1198  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  40.54 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271465  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4893  kynurenine 3-monooxygenase  27.67 
 
 
454 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221128  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.76 
 
 
455 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  26.99 
 
 
415 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  22.95 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4419  kynurenine 3-monooxygenase  46.34 
 
 
453 aa  43.5  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.366347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>