74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1923 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 531 aa  1031    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  56.31 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  45.04 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  39.92 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  40.79 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  40.62 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  40.66 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  40.17 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  40.89 
 
 		 444 aa  299  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  40.25 
 
 		 460 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  38.4 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  37.27 
 
 		 436 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  37.08 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  38.76 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  37.33 
 
 		 477 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 477 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  36 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  31.74 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  33.6 
 
 		 490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  32.94 
 
 		 476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  33.68 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  33.68 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  38.25 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  31.06 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  34.71 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  37.25 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  37.25 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  37.25 
 
 		 460 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  34.43 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  33.2 
 
 		 471 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  33.47 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  32.77 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  31.67 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 457 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  36.44 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  39.12 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  33.81 
 
 		 558 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  25.77 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  25.15 
 
 		 440 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  25.36 
 
 		 440 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  25.56 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  34.48 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  25.15 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  25.15 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  24.9 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  24.9 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  25.36 
 
 		 440 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  29.92 
 
 		 462 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  29.92 
 
 		 462 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  31.87 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  30.3 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  30.91 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  29.55 
 
 		 462 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.85 
 
 		 844 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 509 aa  151  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  29 
 
 		 839 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  25.5 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  31.41 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  27.59 
 
 		 452 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  26.04 
 
 		 497 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 500 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 518 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  25.85 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 437 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  61.22 
 
 		 235 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 447 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>