84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0286 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
445 aa  854    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  42.4 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  45.72 
 
 
484 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  42.79 
 
 
463 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  39.29 
 
 
471 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  38.34 
 
 
453 aa  296  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
447 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  41.48 
 
 
444 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  41.03 
 
 
468 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  41.26 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  40.09 
 
 
459 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  41.2 
 
 
460 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  37.01 
 
 
458 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  38.37 
 
 
463 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  40.28 
 
 
443 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  40.42 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  41.71 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  36.07 
 
 
460 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  40 
 
 
482 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  35.91 
 
 
443 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 
477 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 
531 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  35.21 
 
 
468 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  35.43 
 
 
449 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  35.7 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  33.8 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  33.8 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  34.1 
 
 
452 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  33.8 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
441 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  34.63 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  39.47 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  37.16 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  37.16 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  37.16 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  31.6 
 
 
508 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  37.53 
 
 
477 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  36.27 
 
 
509 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  36.27 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  28.64 
 
 
440 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  35.75 
 
 
449 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.45 
 
 
440 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  28.02 
 
 
440 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  34.68 
 
 
462 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  34.68 
 
 
462 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  28.02 
 
 
440 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  34.68 
 
 
462 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  36.34 
 
 
462 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  28.02 
 
 
440 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  28.31 
 
 
440 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.31 
 
 
440 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  28.18 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.34 
 
 
440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  37.72 
 
 
487 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  27.73 
 
 
440 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 
447 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.65 
 
 
844 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  32.51 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  30.86 
 
 
839 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  33.09 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
472 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
500 aa  116  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  31.57 
 
 
497 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  30.33 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
447 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  57.78 
 
 
235 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  27.5 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  27.61 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  28.35 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.11 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  29.82 
 
 
507 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05546  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  26.65 
 
 
554 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>